Mr. F.W. Baert had in opdracht van de Nederlands-Indische regering een verslag samengesteld over de Japanse bezettingstijn o.a. over de collaboratie en houding van Inonesische intellectuelen waaronder inheemse Binnenlands-Bestuurambtenaren. 

Aan het begin van de Bersiapperiode vluchtte hij uit zijn huis en zocht bescherming in RAPWIkamp II of Toegoerang-kamp in Magenlang , maar vergat bij zijn vlucht bovenstaand belangrijke rapport. In het kamp deed hij werkzaamheden voor het Rode Kruis. 

Waarschijnlijk hadden Indonesische extremisten zijn huis doorzocht en het rapport gevonden en daarom werd hij gearresteerd. In de gevangenis van Magelang werd Mr. Baert samen met Paul van Hoogenhuizen bij hun fouillering met bajonetten neergestoken waarna zij met bamboesperen werden afgeslacht.